一、京区单位协作组
(一)第一协作组(共12个单位)
地理科学与资源研究所、遗传与发育生物学研究所、农业资源研究中心*、遥感应用研究所、生物物理研究所、国家天文台、心理研究所、微生物研究所、生态环境研究所中心、动物研究所、青藏高原研究所、北京基因组研究所
(二)第二协作组(共11个单位)
声学研究所、电子学研究所、化学研究所、理化技术研究所、力学研究所、过程工程研究所、电工研究所、工程热物理所、国家科学图书馆、科技政策与管理科学研究所、国家纳米科学中心
(三)第三协作组(共15个单位)
空间科学与应用研究中心、自动化研究所、物理研究所、计算技术研究所、数学与系统科学研究院、数学研究所*、应用数学研究所*、系统科学研究所*、计算数学与科学工程计算研究所*、理论物理研究所、自然科学史研究所、软件研究所、计算机网络信息中心、科学时报社、光电研究院
(四)第四协作组(共10个单位)
高能物理研究所、古脊椎动物与古人类研究所、植物研究所、中国科学院研究生院、半导体研究所、大气物理研究所、地质与地球物理研究所、微电子研究所、中国遥感卫星地面站、山西煤炭化学研究所
(五)第五协作组(共22个单位)
中国科学院国有资产管理有限责任公司、国科光电科技有限责任公司、北京中科印刷有限公司、科学出版社、中科建筑设计研究院有限责任公司、行政管理局、北京中科资源有限公司、北京中科院软件中心有限公司、中科实业集团(控股)公司、中国大恒(集团)有限公司*、北京中科希望软件股份有限公司*、北京三环新材料高技术公司*、北京中关村科学城建设股份有限公司*、北京中科科仪技术发展有限责任公司*、联想控股有限公司、联想集团有限公司*、神州数码(中国)有限公司*、东方科学仪器进出口集团有限公司、华建电子有限责任公司、中国科技产业投资管理有限公司、中科院科技服务有限公司、中科院人才交流开发中心*
(六)院机关协作组(共15个单位)
办公厅、院士工作局、基础科学局、生物科学与技术局、资源环境科学与技术局、高技术研究与发展局、院地合作局、规划战略局、计划财务局、人事教育局、基本建设局、国际合作局、北京分院(京区党委)、监察审计局、离退休干部工作局
二、京外单位协作组
(一)东北片协作组(共17个单位)
沈阳分院、大连化学物理研究所、金属研究所、沈阳应用生态研究所、沈阳自动化研究所、海洋研究所、青岛生物能源与过程研究所(筹)、烟台海岸带可持续发展研究所(筹)、沈阳计算技术研究所有限公司、沈阳科学仪器研制中心有限公司、青岛疗养院
长春分院、长春光学精密机械与物理研究所、长春应用化学研究所、东北地理与农业生态研究所、农业技术中心*、长春人造卫星观测站*
(二)华东片协作组(共36个单位)
上海分院、上海微系统与信息技术研究所、上海技术物理研究所、上海光学精密机械研究所、上海硅酸盐研究所、上海有机化学研究所、上海应用物理研究所、上海天文台、上海生命科学研究院、生物化学与细胞生物学研究所*、神经科学研究所*、植物生理生态研究所*、健康科学研究中心*、营养科学研究所*、计算生物学研究所*、生命科学信息中心*、上海药物研究所、上海巴斯德研究所(筹)、福建物质结构研究所、宁波材料技术与工程研究所、城市环境研究所(筹)
南京分院、南京地质古生物研究所、南京土壤研究所、南京地理与湖泊研究所、紫金山天文台、南京中科天文仪器有限公司、南京天文光学技术研究所*、苏州纳米技术与纳米仿生研究所(筹)、庐山疗养院
合肥物质科学研究院、安徽光学精密机械研究所*、等离子体物理研究所*、固体物理研究所*、合肥智能机械研究所*
中国科学技术大学
(三)中南片协作组(共19个单位)
武汉分院、武汉岩土力学研究所、武汉物理与数学研究所、武汉病毒研究所、测量与地球物理研究所、水生生物研究所、武汉植物园、国家科学图书馆武汉分馆*
广州分院、南海海洋研究所、华南植物园、广州能源研究所、
广州地球化学研究所、长沙矿产资源勘察中心*、亚热带农业生态研究所、广州生物医药与健康研究院、深圳先进技术研究院(筹)、广州化学有限公司、广州电子技术有限公司
(四)西南片协作组(共14个单位)
成都分院、成都生物研究所、成都山地灾害与环境研究所、光电技术研究所、国家科学图书馆成都分馆*、成都有机化学有限公司、四川中科院信息技术有限公司、成都中科唯实仪器有限责任公司、
昆明分院、昆明动物研究所、昆明植物研究所、西双版纳热带植物园、地球化学研究所、云南天文台*
(五)西北片协作组(共16个单位)
西安分院、西安光学精密机械研究所、地球环境研究所、国家授时中心
兰州分院、近代物理研究所、兰州化学物理研究所、寒区旱区环境与工程研究所、青海盐湖研究所、西北高原生物研究所、国家科学图书馆兰州分馆*、兰州油气资源研究中心(筹)
新疆分院、新疆理化技术研究所、新疆生态与地理研究所、乌鲁木齐天文站*
注:以上共计187个单位,其中京区85个单位,京外102个单位。带*号的一般为非独立法人的二级单位,可参加所在协作组的业务活动。